Me alegra que sepas que la Biblia no cayo del cielo, asi armadita y dividida en capitulos y versiculos.No es como dices. Tenemos claro como fue la historia para llegar al canon. Y ademas, no existe un solo canon.
Ciertamente se trato de un proceso donde no se distinguia entre libros inspirados y no inspirados como afirmas porque esta nocion todavia no existia. Los judios de entonces todavia no habian definido el canon , aceptaban la torah ( pentateuco para cristianos) , los textos profeticos, en particular el de Isaias y los Salmos. Recien a mediados del siglo II , el judaismo cierra su canon.
El proceso para reconocer y juntar los libros del Nuevo Testamento comenzó en los primeros siglos de la iglesia cristiana. Muy temprano, algunos de los libros del Nuevo Testamento fueron reconocidos como inspirados.
En Antioquía, en el año 200, se utilizaba el llamado "Evangelio de Pedro" (considerado actualmente uno de los evangelios apócrifos). Tambien circulaban evangelios y epístolas falsas como por ejemplo el "Evangelio de Tomás" (promovido por los gnósticos), el "Evangelio de Maria Magdalena", cartas de San Pablo no escritas verdaderamente por él.
Pablo considera que las escrituras de Lucas son tan autoritativas como el Antiguo Testamento (1 Timoteo 5:18, ver también Deuteronomio 25:4 y Lucas 10:7). Pedro se refirió a las escrituras de Pablo como Escritura (2 Pedro 3:15-16). Clemente de Roma mencionó al menos ocho libros del Nuevo Testamento (95 DC). Ignacio de Antioquía reconoció siete libros (115 DC). Policarpo, un discípulo de Juan el apóstol, reconoció quince libros (108 DC). Más tarde, Ireneo mencionó veintiún libros (185 DC). Hipólito reconoció veintidós libros (170-235 DC).
El texto anterior lo tomaste de https://www.gotquestions.org/Espanol/canon-Biblia.html
Pero te falto esto de este mismo site
Policarpo, un discípulo del apóstol Juan, reconoció 15 libros (108 d.C.). Más tarde, Ireneo mencionó 21 libros (185 d. C.). Hipólito reconoció 22 libros (170-235 d.C.). Los libros más controvertidos del Nuevo Testamento fueron Hebreos, Santiago, 2 Pedro, 2 Juan y 3 Juan.
El primer “canon” fue el Canon Muratori, que fue compilado en el año 170 d.C. El Canon Muratori incluyó todos los libros del Nuevo Testamento, excepto Hebreos, Santiago y 3 Juan. En el año 363 d.C, el Concilio de Laodicea declaró que sólo el Antiguo Testamento (junto con la Apócrifa) y los 27 libros del Nuevo Testamento debían ser leídos en las iglesias. El Concilio de Hipona (del año 393 d.C.) y el Concilio de Cartago (del año 397 d.C.) también confirmaron la autoridad de los mismos 27 libros.
Lo que NO dice es que los concilios arriba citados Hipona Y cartago fueron convocados por la Iglesia Catolica .