Angelguarda, Dios no es hombre para que se le compare con nosotros. Lo que sabemos de Dios es que es un espíritu, y la Biblia le llama "El Espíritu", indicando que es único.
Sabemos que Dios tiene un lugar donde está, aunque por medios diferentes accede a cualquier sitio. Su presencia en dicha ubicación se constata con los relatos de la Biblia acerca de asambleas generales de ángeles y seres celestiales delante de lo que la Biblia llama Su "trono", y hasta se ubica a Jesús cerca de Él, a su lado o tomando un rollo de Su mano. Eso nos dá la idea de que Dios tiene una apariencia visible en algún lugar del Universo, aunque ese lugar fuera en algún plano que no conocemos completamente.
Sabemos también que tiene sentimientos: amor, bondad, etc. y además se usan en la Biblia palabras que expresan sensaciones en Él, como agrado o desagrado por ciertas cosas, lo cual demuestra mediante su repulsión o rechazo, o su aprobación y agrado, etc.
Todas esas cosas que sabemos de Dios, incluídas cualidades como su amor por la justicia, su sabiduría, etc, nos hacen pensar en él como una persona, un ser individual. Esto, lógicamente, humanamente hablando, es tener un alma, porque tiene sentimientos.
Mira, por ejemplo, a veces decimos cosas como: 'se me parte el alma de ver su sufrimiento', 'me alegro desde el fondo de mi alma', 'tengo el alma hecha pedazos', etc. Ninguna de estas expresiones habla acerca de algún alma física (en sentido de existencia real), sino del interior de la persona, de sus sentimientos, etc. Eso mismo es lo que expresan frases como las que tú has mencionado, que usan "el alma de Dios" como metáfora de sus sentimientos.