No veo la incongruencia.
Es totalmente posible decir que A contiene a B sin que esto signifique que A es igual a B.
Es decir, es posible afirmar que La Biblia contiene la Palabra De Dios ( o que la Palabra De Dios está EN la Biblia) y a la vez que la Biblia no ES la Palabra De Dios.
El punto es que todo el contenido de la Biblia es un registro de hechos que sucedieron. Es decir, la Biblia registra acontecimietos reales, que es historia. Y desde luego, incluye la Palabra de Dios. Y no es tan simple como decir, que en la Biblia esta la Palabra de Dios y que la Biblia no es Su Palabra. Pues, para el cristiano cuando cree en Dios de hecho tambien cree en la Biblia. No se puede decir, creo en la Biblia la parte de su registro que me convence que fue real, y otras partes que no, por que no me convence que fueron verdaderas. Es es la incongruencia, que un creyente cree en la Biblia pero que no cree en la Biblia.