Hola Caminante:
"Secta" viene del latín "sequi" = Seguir.
Los seguidores de algún maestro que, aunque originalmente miembro de una comunidad religiosa, disentía de alguna enseñanza, o del liderazgo de la comunidad, etc. sin necesariamente rechazar la religión "madre". Originalmente no era originalmente un término tan peyorativo como a veces se usa ahora, asociado a cosas como "lavado de cerebro", tácticas coercitivas, manejo fraudulento de fondos, marketing escandaloso, culto a la personalidad del líder, etc.
Y sí, algunas religiones comenzaron considerándose "sectas" de una religión anterior.
Los cristianos eran vistos como una secta del judaísmo por los romanos, a pesar del afán de cristianos de verse como una religión independiente.
Es posible que Juan el Bautista fuera de la secta de los esenios.
Los baha'i eran vistos como secta del Islam chiíta, mientras que los chiítas eran vistos como una secta en los ojos de los musulmanes sunnitas.
Los primeros musulmanes eran vistos por los árabes contemporáneos como una secta del judaísmo o del cristianismo.
Los budistas eran vistos como una de las tantas sectas de la religión hindú.
La adoración exclusiva a YVWH parece haber sido una secta de una religión palestina más antigua y que abarcaba la adoración a Astarté.
Respecto a los protestantes, ni hablemos.
Pero ahora tenemos que luteranos o metodistas ven a momones como "secta" cuando ellos mismos fueron vistos como "secta" por los católicos.
Los mormones son vistos como "secta", pero ellos consideran sectas a los que no siguieron a Brigham Young sino a otros líderes.
Respecto a tu pregunta de que si hay algo de verdad en las sectas, opino que hay algo de verdad en todas las tradiciones espirituales, filosofías y formas de ver la vida.
El reto está en primero, disecar la verdad del error y luego, aprender a integrar la verdad para convivir juntos en paz en torno a un objetivo común.